《文物保护与考古科学》是由上海博物馆主办的学术期刊，主管单位为上海市文化和旅游局(上海市广播电视局、上海市文物局)。
上海博物馆设立文物修复工场始于1958年，1960年又设立了文物保护与考古科学实验室，成为国内文物博物馆系统最早文物保护与考古科技学术研究机构之一。1985-1988年，实验室编印了《国外自然科学与文物考古技术》情报资料14期，这些资料杂志即本刊的前身。
1989 年，上海博物馆正式创办《文物保护与考古科学》期刊，旨在充分报道国内外文物考古界的科研成果，让更多的文物工作者与爱好者了解、传递和交流在文物保护与考古中的传统或先进的科技方法，从而促进科学技术在古文物研究领域中的应用、提高我国文物保护水平和推动科技考古的深入研究。刊物的首任主编是马承源馆长。
1993年，期刊获得国家统一出版物刊号(CN31-1652/K)和国际连续出版物标准刊号(ISSN1005-1538)，同年被上海市科委、新闻出版局、市科协联合评比为上海市优秀科技期刊。1994年起，《文物保护与考古科学》被本领域著名国际文摘杂志AATA收录。2003年，刊物改为季刊。2017年，刊物改为双月刊。2021年，期刊被国际数据库Scopus收录，成为首个被该数据库收录的中文文物博物馆专业期刊。期刊入编《中文核心期刊要目总览》，为“中国科技核心期刊”(中国科技论文统计源期刊),“中国人文社会科学核心学术期刊”“RCCSE中国核心学术期刊”“中国最具国际影响力学术期刊”。
《文物保护与考古科学》期刊以社会效益为主，充分体现文博科技的专业特色，主要报道文物科技领域中的研究、应用成果，以创新和实用相结合、提高与普及并重为特点，反映国内外同领域研究中的新进展和动向。自创办以来，在广泛进行技术交流，加快文物科研成果的推广应用，推动我国文物科学保护事业的发展方面发挥了积极的作用，并在行业内及海内外具有一定的影响。
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